生物碱 (alkaloids) 是一类含氮的有机化合物，存在于自然界（一般指植物，但有的也存在于动物）。有似碱的性质，所以过去又称为赝碱。大多数生物碱均有复杂的环状结构，氮素多包括在环内，具有光学活性。但也有少数生物碱例外。
生药中生物碱的含量大多低于 1% ，少数含量特别低，如长春花中长春新碱含量为百万分之一，美登木中美登木素含量为千万分之一；也有些含量特别高，如黄连中小檗碱含量可达 9% 、金鸡纳皮中奎宁含量高达 15% 。在植物体内，生物碱一般与有机酸（苹果酸、枸橼酸、酒石酸和鞣酸等）结合成盐类，呈溶解状态存在于液泡中，有些是与糖结合成苷而存在，也有少数生物碱呈游离状存在，如咖啡碱 (caffeine) 与秋水仙碱 (colchicine) 等。
已知生物碱种类很多，约在2，000种以上，有一些结构式还没有完全确定。它们结构比较复杂，可分为59种类型。随着新的生物碱的发现，分类也将随之而更新。由于生物碱的种类很多，各具有不同的结构式，因此彼此间的性质会有所差异。但生物碱均为含氮的有机化合物，总有些相似的性质，如：
1）形态：大多数生物碱是结晶形固体；有些是非结晶形粉末；还有少数在常温时为液体，如烟碱（Nicotine）,毒芹碱（Coniine）等。
生物碱种类繁多，按母核的基本结构分为 60 类左右，主要有以下 12 类：
(1) 有机胺类 (amine) ：氮原子位于直链上，如麻黄碱、益母草碱、秋水仙碱等；
(2 ) 吡咯烷类 (pyrrolidine) ：如古豆碱、千里光碱、野百合碱、娃儿藤碱等；
(3) 吡啶类 (pyridine) ：如菸碱、槟榔碱、半边莲碱、苦参碱等；
(4) 喹啉类 (quinoline) ：如奎宁、喜树碱等；
(5) 异喹啉类 (isoquinoline) ：如小檗碱、吗啡、粉防已碱、石蒜碱、可待因、青藤碱、锡生藤碱等；
(6) 喹唑酮类 (quinnazolidone) ：如常山碱等；
(7) 吲哚类 (indole) ：如利血平、长春碱、麦角新碱、士的宁等；
(8) 莨菪烷类 (tropane) ：如莨菪碱、东莨菪碱、古柯碱等；
(9) 亚胺唑类 (imidazole) ：如毛果芸香碱等；
(10) 嘌呤类 (purine) ：如咖啡碱、茶碱、香菇嘌呤、石房蛤毒素等；
(11) 甾体类 (steroid) ：如茄碱、贝母碱、藜芦碱、澳洲茄碱等；
(12) 萜类 (terpenes) ：如猕猴桃碱、石斛碱、乌头碱、飞燕草碱、黄杨碱等。
2) 颜色：一般为无色。只有少数带有颜色，例如小 碱（Berberine）、木兰花碱（Magnoflorine）、蛇根碱（Serpentine）等均为黄色。
3）味感：不论生物碱本身或其盐类，多具苦味，有些味极苦而辛辣，还有些刺激唇舌的焦灼感。
4）酸碱反应：大多呈碱性反应。但也有呈中性反应的，如秋水仙碱；也有呈酸性反应的，如茶碱和可可豆碱；也有呈两性反应的，如吗啡（Morphine）和槟榔碱（Are
