毫米波治疗仪的辐射功率一般<150MW，功率密度<10M人CM2.在这个能量下，生物系统吸收毫米波电磁能量后产生不属于温度变化的生物学改变，即非热效应。通俗的讲就是毫米波在治疗疾病的过程中，是在不使人体温度升高的前提下进行的。
非热效应的应用
因运动损伤而造成的淤血瘀肿及软组织损伤，24小时内只能采取冰敷加压的方法，一般的理疗仪器因有热效应，会加重损伤部位的出血造成二次损伤，毫米波治疗仪的非热效应可以在损伤后立即进行治疗，从而赢得治疗时机。
远位效应
人体对毫米波的吸收率极高，在皮肤表层1MM内处就被完全吸收掉。但由于毫米波辐射场内存在着感受细胞、免疫细胞、神经末捎和血管等，而在人体内部具有复杂的自我调节系统，通过内部的能量和信息的传递、转换、加工等，毫米波辐射作用可影响到远离辐射区的组织或器官，即远程效应，也称远位效应。通俗的讲就是毫米波在治疗局部疾病的同时，远离治疗部位的疾病也同时的治疗。
时间积累效应
毫米波的生物学效应在照射开始后的一定时间才显示出来，某种情况下，需照射多次，才能表现出明显效应，这就是生物学当中的时间积累效应。
