隐蔽性，给人的认识和把握带来了难度。主观方面，一定历史条件下人的认识能力是有限的，个体的认识能力是有差别的，对成本的认识是一个不断深化的过程。因此，经常会有许多成本因素暂时不被人所发现和认识。第二类原因是不正当的经济行为。导致不正当经济行为的根本原因在于作为经济活动主体的人的职业生涯的短暂性和经济组织收益长期最大化之间的矛盾；经济人追求个体收益最大化的本性与整个社会经济利益的全局性和长期性之间的矛盾。
企业管理过程中导致隐性成本存在和增大的常见原因主要有以下几种：
（1）信息失真。包括内部信息失真、外部信息失真、内外信息不对称三个原因造成的企业成本无形增大。内部信息失真是系统内部的上下级之间、部门之间的真实信息散失和虚假信息传递。外部信息失真是企业对所面临的外部环境的错误认知。内外信息不对称是指企业一方面对于宏观经济政策、市场竞争态势、行业状况和竞争对手的情况不了解，另一方面为了自己的生存和发展又在大量地向社会散布有利于自己的信息、封锁对自己不利的信息。
（2）内部摩擦。企业内部机构设置的职能划分不清，机构的职能重叠和空白同时存在，工作开展过程中争权夺利、推诿扯皮不断，内部运作效率低下，隐性成本非常高，许多对企业十分有利的事情在外面能够迅速办妥，但往往在内部部门之间被卡住了，企业自己制约着自己的发展。
（3）权威失灵。企业领导者的权威受损甚至失灵，令不行，禁不止，各自为政，或阳奉阴违，或消极抵触，表面应付，造成工作效率、工作质量难以保证，影响到生产、销售，特别是客户关系，使企业隐性成本不断增大。
（4）信用丧失。主要是外对客户和社会，内对员工丧失信用。丧失了信用也就失去了发展过程中的支持力。轻则经营成本增大，重则丧失客户、丧失优秀员工，使经营难以为继。
（5）品牌损失。一个企业的品牌是靠产品的质量、良好的顾客关系、细致入微的销售手段和能使顾客满意的售后服务等组成的。而品牌一旦形成，它将成为企业发展的重要标志和体现。品牌运作得好，尽管花费少，但其增值量会远远大于实际投入的资金的积累量；如果运作得不好，尽管花费多，但品牌的价值增值少、不增值甚至损失。
（6）激励约束失当。一方面是对代理人的约束软化，会使其占有和支配所有者的资源的动机发生变化。他们为了自己的个人利益，可能想方设法支配更多的资源牟取私利。另一方面，激励措施失当，该多得的少得，该少得的多得，该奖的不奖，该罚的不罚，奖懒罚勤，奖亲罚疏，这样会造成整个组织的内部成本快速增大。
（7）谈判成本（交易成本）。市场交易中谈判双方以各种方式展开博弈（讨价还价）的成本，其中包括以请客送礼等方式获取对方信息、拉拢腐蚀对方工作人员，损害其委托的利益等等非正当的谈判手段所形成的隐性成本。
（8）决策失误。急于求成，好大喜功；信息不全，判断错误；目光短浅，决策能力差；优柔寡断
